Người Công Giáo tin rằng trong Bí tích Thánh Thể — khi bánh và rượu được làm phép — thực sự trở thành Mình và Máu Chúa Giêsu. Qua lịch sử, có nhiều câu chuyện phép lạ dường như minh chứng cho niềm tin này. Mặc dù Giáo hội từng điều tra và nhìn nhận một số phép lạ là có tính siêu nhiên, nhưng không ai bị bắt buộc phải tin những chuyện này. Giáo lý về biến đổi bản thể dựa vào Kinh Thánh và truyền thống Tông đồ, chứ không phải vào từng câu chuyện kỳ lạ riêng lẻ. Tuy vậy, có một số trường hợp phép lạ Thánh Thể vẫn còn có thể được chiêm ngưỡng ngày nay:
1) Phép lạ Thánh thể tại Lanciano (thế kỷ VIII)
Một linh mục ở Lanciano (Ý) từng hoài nghi về sự hiện diện thật của Chúa trong Thánh Thể. Trong một lễ, khi đọc lời truyền phép “Đây là Mình Ta, đây là Máu Ta”, bánh và rượu đã hóa thành thịt và máu thật. Máu kết thành năm khối, được cho là tượng trưng cho năm vết thương chí thánh của Chúa Giêsu. Giáo hội địa phương đã điều tra và công nhận phép lạ này.
Cho đến ngày nay, thịt và máu đó vẫn còn được bảo tồn trong Nhà thờ San Francesco ở Lanciano. Năm 1971, giáo sư giải phẫu Odoardo Linoli phân tích mẫu thử, xác định mô là mô tim và máu có đặc tính của máu tươi, không hề dùng chất bảo quản.
2) Khăn Thánh tại Bolsena, Ý (thế kỷ XIII)
Một linh mục có mặt tại Orvieto từng nghi ngờ về bí tích Thánh Thể. Trong lễ truyền phép, khăn thánh đặt dưới bánh Thánh rỉ máu. Từ đó, linh mục đem kể lên Giáo hoàng — người lúc ấy đang tới thăm Orvieto — để thú nhận. Câu chuyện này được truyền tụng rồi được Giáo hội tôn kính. Khăn thánh vẫn được trưng bày tại Nhà thờ Orvieto.
3) Bánh Thánh tại Siena, Ý (năm 1730)
Ngày 14 tháng 8 năm 1730, trong lễ vọng kính Đức Mẹ Vô Nhiễm, ở Siena, bánh Thánh (đã làm phép) bị kẻ trộm lấy mất từ Nhà thờ Thánh Phanxicô. Hai ngày sau, người ta tìm thấy những chiếc bánh thánh bị đánh cắp — vẫn nguyên mặc dù bị bỏ trong một thùng tiền dâng cúng, có mạng nhện và bụi. Sau khi được sạch sẽ, chúng được đặt trở lại Nhà thờ Thánh Phanxicô, để tôn kính (không dùng trong phụng vụ). Sau nhiều thập kỷ, bánh Thánh không bị hư hỏng mà vẫn nguyên như cũ.
4) Phép lạ tại Chirattakonamê, Ấn Độ (năm 2001)
Trong buổi chầu Thánh thể tại Giáo xứ Thánh Maria, vào ngày 28/4/2001, bỗng có ba vết đỏ xuất hiện trên bánh Thánh. Sau đó vài ngày, khi kiểm tra lại, những vết này dường như sắp xếp thành hình khuôn mặt một người đàn ông (có thể hợp để tín hữu liên tưởng tới Chúa Giêsu). Linh mục đã chụp ảnh lại để ghi nhận.
5) Phép lạ Thánh Thể ở Santarém, Bồ Đào Nha (thế kỷ XIII)
Một phụ nữ ở Santarém, vì chồng không chung thủy, đã nhờ một phù thủy giúp. Phù thủy bảo bà phải mang một bánh Thánh đã làm phép. Bà tham dự Thánh lễ, rước lễ rồi lấy bánh ra khỏi miệng, quấn vào mạng che mặt rồi đi giao cho phù thủy. Trước khi ra khỏi nhà thờ, bánh bắt đầu chảy máu. Khi về nhà, bà đặt bánh trong một rương, và cả đêm có ánh sáng huyền ảo phát ra từ cái rương đó. Bà ăn năn, xưng tội với linh mục, rồi linh mục tới lấy lại bánh đưa về nhà thờ để tôn kính. Bánh Thánh này được cho là vẫn còn được lưu giữ đến nay. Nhà thờ nơi xảy ra phép lạ được đổi tên thành “Nhà thờ Phép lạ”
